台灣高鐵指出，這次故障初步研判與「轉轍器控制機箱（SMC）」電源模組異常有關。該設備屬高鐵自2024年啟動、為期3年的號誌系統更新計畫之一，截至目前已完成全線458組中的371組更換，比例達83.5%，此次則是首次出現異常狀況。高鐵已將故障設備完整保存，後續將與設備原廠及第三方專業單位共同釐清根因。
高鐵說明，異常發生於25日清晨4時27分，維修人員在苗栗路段進行夜間例行設備更換時，發現號誌訊號異常，立即啟動故障排除程序，並成立緊急應變中心（EOC）。為維持基本運輸服務，全天採取單線雙向運轉，每小時雙向各開行3班全車自由座列車，雖盡力降低衝擊，仍造成大量旅客延誤與不便。
為確保今日能恢復正常營運，高鐵維修團隊於昨晚末班車通過後立即進場搶修，並在凌晨完成設備更換。高鐵董事長史哲也於今晨3時30分親自主持緊急應變會議，確認各項設備正常後，宣布今日恢復正常通車。
對於外界質疑近年高鐵異常事件頻傳，高鐵公司則澄清，去年統計的42件異常事件中，有20件屬颱風、地震等不可歸責因素，若僅計算可歸責高鐵的異常案件，與過去10年平均值相當，人為因素更僅3件，強調整體營運安全與準點表現仍維持高水準。
高鐵強調，高速鐵路對號誌安全要求極高，一旦訊號異常即必須依標準程序降速或調整營運，以確保行車安全，未來也將加速調查與檢討，避免類似事件重演。
針對這次事件，交通部長陳世凱今(26日)出席台61線平交路口改善計畫苗栗段動土典禮表示，高鐵公司已漏夜完成搶修，讓列車今日順利恢復正常，但交通部已要求高鐵儘速釐清故障原因，「尤其是道岔訊號異常的部分，必須趕快找出問題。」他指出，高鐵公司已成立專案小組展開調查，後續將持續追蹤改善進度。
陳世凱也提到，高鐵公司已向受影響旅客致歉，並於今日在各車站提供點心、麵包及礦泉水，向旅客表達歉意。他坦言，自己今天搭乘高鐵時，也在苗栗站看到相關補償措施。
此外，針對昨日退票民眾大排長龍的情況，陳世凱透露，已要求高鐵研議「線上退票機制」，讓透過手機或網路購票的旅客，可直接在線上完成退票程序，減少臨櫃排隊的不便。他表示，昨日不少民眾符合50%或全額退票資格，若能線上處理，將大幅提升便利性。
