根據航班資訊網站 Flightradar24 的飛行軌跡顯示，執飛NH968航班的波音767-300ER客機（註冊號JA626A）當時正飛越東京灣，準備降落羽田機場C跑道（34R）。
與此同時，一架日本民航局的賽斯納Citation CJ4飛行檢查機（註冊號JA010G）自D跑道（05）起飛後，正轉向飛往神奈川縣三浦半島方向，兩機因此在羽田機場附近空域接近。
在TCAS發出交通警告與解決指令（Resolution Advisory）後，全日空航班立即依照系統指示執行規避機動，並於東京灣上空重新盤旋等待，再次進場降落。該航班最終於上午6時10分安全降落羽田機場，比原定時刻延誤約25分鐘。
全日空表示，NH968航班當時載有187名乘客及10名機組員，共197人在機，事件中無人受傷。
日本媒體公布的航空無線電通訊紀錄顯示，事件發生時，東京機場進場管制員曾以激動語氣向塔台詢問：「你們沒有看到進場的飛機嗎？」塔台則回覆表示，全日空客機的TCAS已經啟動，現場一度陷入混亂，並感嘆「太危險了」。
社群平台上流傳的資訊更稱，兩機最近距離可能僅約20公尺，引發外界高度關注。不過截至目前，日本官方尚未公布兩機實際最近接近距離，也未證實「20公尺」的說法。相關事件原因及管制程序是否存在疏失，仍有待日本運輸安全相關單位進一步調查釐清。
