鄭凱云形容，無論是在重要醫學會議或大型活動場合，吳明賢總是帶著溫暖笑容，以幽默風趣的談吐化解現場的嚴肅氣氛。他對後輩的提攜與包容也令人印象深刻，總是不吝分享經驗，鼓勵年輕醫師勇於承擔責任，展現出醫者少見的溫度與親和力。
身為國內胃腸肝膽科權威，吳明賢深耕醫療超過30年，累積發表超過500篇國際論文，並帶領團隊推動幽門螺旋桿菌根除治療，對全球胃癌防治指引產生重要影響。他長年投入臨床、研究與教學，也持續推動醫學與公共衛生的進步。
他在醫界最常被提及的一項理念，是以服務、教學、研究要並重的「胡椒鹽精神」，提醒年輕醫師，認為醫療工作不能偏廢任何一環，如同料理少了任何調味，都難以完整。
2020年8月吳明賢接任台大醫院院長後，隨即面對新冠疫情最嚴峻的挑戰。當時台大醫院承擔重症收治壓力，他在第一線協調醫療量能，並向全院同仁表示：「台大醫院是守護台灣人民健康的最後防線，我們退無可退。」這段話成為許多醫護人員在艱困時刻的重要支撐。
除了專業領導，他也多次在公開演講及醫學教育場合強調：「科學讓醫學強大，人文讓醫學有溫度。」在他眼中，醫師面對的不只是疾病與器官，更是一個有痛苦、有恐懼、需要被理解的生命個體。
如今，這位長年站在第一線守護病人的醫界領袖，卻驚傳OHCA正在搶救中，仍在與死神拔河。消息傳出後，醫界曾與他共事的同仁、病患紛紛發文為他集氣，盼望奇蹟出現。
