爭議源自書中一篇〈臺灣原住民族土地權運動與體現知識〉文章，前言提及另一名學者對布農族學者海樹兒（Haisul Palalavi）的批評「知識都是從書上看來的、他去過他所談的那些祖居地嗎？」海樹兒反駁「完全不符合事實」，進而掀起學界與原民社群連日討論，甚至延燒至立法院。
民進黨籍原住民立委伍麗華強調，爭議核心在於作者未經查證，即引用田野訪談中對他人的評價，且未進行去識別化處理，導致文字成為傷害當事人的工具。她直言，「這段文字等於是一把刀，造成不白之冤」，不僅傷害當事人名譽，更可能讓族群遭到標籤與撕裂。
伍麗華批評，研究者在知識生產過程中握有詮釋與書寫權力，理應負起查證與保護責任，但本案卻顯示對原住民族社會脈絡理解不足，甚至重現過去殖民式研究視角的問題。伍麗華強調，依《原住民族基本法》，在原住民族土地進行研究，應取得部落同意與參與，學術倫理已不只是自律問題，更是法律義務。
在各界壓力下，專文作者、中央研究院民族學研究所副研究員楊淑媛於17日發表道歉聲明，她坦承論文「引述失當」，已對海樹兒教授學術名譽造成損傷與誤解，並強調絕非本意，為此致上「最誠摯的歉意」，她同時承諾，將針對論文內容進行修訂，並在獲得當事人確認同意後再行公開。
出版單位台大出版中心則是接連2天發出道歉聲明，主編史書美、蔡林縉在聲明文強調，除代表全書編輯團隊致歉外，也坦言在編輯過程中未能善盡查核責任，導致對當事人造成傷害，對此「責無旁貸」，將全力進行補救，並於後續公開完整澄清與說明。
台大出版中心在聲明文說明，已收到作者正式道歉聲明並代為轉發，對編輯過程未及時察覺爭議致歉，向受影響的當事人、讀者及各界致上最深歉意。出版中心強調，目前該書自16日起全面停止各通路販售，除了展開內部檢討與溝通，也與主編及作者研議修訂與後續處理方式。
