楊祐寧的父親楊進元是知名餐廳「元鍋」創辦人，爽朗好客，許多圈內藝人喊他「Daddy」。楊祐寧雖然能夠接受爸爸離開的事實，但形容爸爸過去「存在感很強」，過年家人團聚時刻，少了一個帶動氣氛的人，一下子覺得「少了很多」，「大家都滿想念他的。」
爸爸去年10月12日離世，而楊祐寧與老婆王詠穎（Melinda）9月12日宣布小兒子「Eli」出生，去年悲喜交加。前陣子楊祐寧與老婆帶兩個女兒去北海道滑雪，兒子交給阿嬤照顧，記者會受訪時戴著口罩，透露因為出去玩時小孩感冒，自己被傳染，結果狀況比小孩更嚴重。
女兒們黏媽媽！楊祐寧自嘲擠不進去
晉升三寶爸，楊祐寧在社群上分享3個孩子擠在一起的照片，笑稱姊姊們對弟弟是「窒息的愛」，「有一些浮誇的表現，想表達姊姊對他的愛，兩個人爭先恐後的愛弟弟，我在旁邊看覺得很好笑。」例如姊姊們對弟弟一直親、把他當玩具，弟弟就是一個「很傻的臉」。
兩個女兒分別5歲、2歲半，比較黏媽媽，睡覺一定要讓媽媽睡中間，楊祐寧自嘲：「我也希望擠在裡面，但只能在邊邊，我沒有位置。」自己的工作是負責接送，以及一些日常瑣事。
為關懷「慢飛天使」孩子拍攝影片，楊祐寧回家也會跟孩子分享，並表示，在公眾場合常會看到一些小朋友出現沒辦法理解的行為，希望大家給他們的家庭多一些時間、空間，並成為全體社會共識。
楊祐寧透露，過年前剛結束一部台灣、日本、波蘭三方合作的電影拍攝工作，探討安樂死議題，他飾演醫生，今年有機會製作完成。其他工作要等各單位陸續開工之後，再開始進行。
