根據港媒報導，黎智英與《蘋果日報》相關的三間公司包括蘋果日報有限公司、蘋果日報印刷有限公司及蘋果日報互聯網有限公司，被控一項串謀發布煽動刊物罪及兩項串謀勾結外國勢力罪。案件由三名國安法指定法官杜麗冰、李運騰及李素蘭審理。黎智英自2020年12月起還柙，至今已被拘押逾四至五年。
黎智英被指控與《蘋果》高層串謀，發布合共161篇煽動刊物，並透過報章及英文版平台，鼓吹反政府行動及向外國請求制裁中港政府。檢方亦指，黎曾向高層發出多項編採指示，包括要求放大報導陳方安生與時任美國副總統彭斯會面的新聞、集中呈現2019年7月1日衝擊立法會年輕示威者的心聲，以爭取公眾理解，以及訪問銅鑼灣書店前店長林榮基，以催谷市民上街反對修訂《逃犯條例》。
就勾結外國勢力的指控，檢方指黎智英透過其助手Mark Simon，與「重光團隊」成員李宇軒、陳梓華，以及劉祖廸等人合作，推動國際遊說行動。檢方指出，黎曾為全球登報計劃墊支費用，又鼓勵相關人士打「國際線」，影響外國對華政策，推動制裁。黎亦被指於2019年兩度訪美，會晤時任美國副總統彭斯、國務卿龐培歐，以及在港會見到訪的美國參議員Rick Scott，遊說支持涉制裁中港的《香港民主人權法案》。
多名《蘋果》高層及重光團隊成員早前已認罪，其中六名高層轉為控方證人，指稱黎智英多次作出編採及行動指示。控方認為，即使《國安法》生效後未有新的串謀協議，只要被告繼續執行原有計劃，已足以構成犯罪，並指黎未有下架涉及制裁的內容，反映其持續推動相關行為，是整個串謀的主腦。
黎智英自辯時否認指控，強調《蘋果日報》編採獨立，自己只是作出新聞判斷上的建議。他承認曾指示「做大」部分新聞，以及在《國安法》生效前發起「一人一信救香港」行動，但否認在法例生效後再提及制裁。他解釋與重光團隊接觸的目的，是希望平息勇武派行動，並稱直至庭審期間才知悉相關組織的實際運作。對於其社交平台帖文及直播節目，黎表示內容屬推測或事實陳述，僅希望爭取國際關注，從未尋求實際制裁行動。
辯方則主張，新聞機構監察政府、批評施政屬合理行使言論及新聞自由，傳媒應較一般公眾享有更大表達空間。檢方反駁指，被告明知相關文章具煽動意圖仍然刊登，已構成違法。法官亦多次指出，發表意見與要求制裁屬不同概念，並強調裁決只會基於證據及法律。
案件裁決當日，法院將開設正庭及七個設有視像的延伸庭，共提供逾600個記者及公眾旁聽席位。司法機構已公布旁聽安排，傳媒自前一日起排隊輪候入場。案件結果將對《國安法》下勾結外國勢力及煽動罪的法律界線，產生重要影響。
