竹北藍白分裂，連帶影響竹縣選情；與國民黨新竹縣長參選人徐欣瑩交好的美麗島電子報董事長吳子嘉近日公布竹北市長最新民調，顯示若藍白不合，國民黨參選人吳旭智領先民進黨參選人曾聖凱、民眾黨參選人邱臣遠。此舉遭邱批評是要削弱他參選的正當性，並操作棄保。
柯文哲今受訪時表示，自己當了很久的醫生，用醫生的思維來看，若病人發生車禍血流不止，送到台大醫院急診室，這時候再去罵肇事者是毒駕、酒駕、超速闖紅燈都沒有用，應該先止血再說。政黨合作不能保證每個環節都符合，偶爾還是會踢到鐵板，但出事還是要盡快善後，所以他2週前就開始呼籲民眾黨主席黃國昌、國民黨主席鄭麗文趕快善後。
「一件事情一旦開始運作，激起民眾情緒，就很難控制。」柯文哲說，他現在想的不是新竹的問題，在考慮的是外溢效應，應該趕快善後，防止外溢效應，才是當前所要。他也直言，在這狀態下，有時想想國民黨很奇怪，成熟的政治不該像美麗島電子報董事長吳子嘉這樣，一下子提告民眾黨，一下子發布民調，一連串的動作會激怒人家。
柯文哲強調，竹北的市話普及率只有5成，而65歲以上人口在竹北大概只有10％，這也是為何2024年選舉民眾黨在竹北得票率人口特別高，這也是人口結構的問題。現在竹北出現整合問題，他不會特別去責怪誰，但事情不解決、拖在那裡，這真的的，真的會失控，造成外溢效應。
柯文哲坦言，政治上支持者的情緒，不要以為領導者說轉彎就可轉彎，有時沒那麼容易。他進一步指出，台北市民自主性相對較高，就台北選情來看，相對穩定，但宜蘭、新北、高雄才是嚴重，會受到波及；而彰化縣已經大勢已去，新竹縣看來也是很難挽救。
