衛福部表示，因應少子化，外界多次期盼成立兒童專責機構，為此，衛福部將設立「兒少及家庭支持署」，下設兒少健康組、保護安置組、家庭支持組、兒童權利、托育服務組及綜合企劃組，監督及管理所屬4家兒少機構，目標為落實總統健康台灣願景、整合兒少健康與福利業務，涵蓋預防保健、早期療育，到托嬰托育、福利與保護等，建立完整的兒少支持體系，並強化家庭支持功能與韌性。
另外，衛福部指出，隨著超高齡社會來臨，為了精進照顧服務，設立「長期照顧及社會發展署」，並整合長者、身心障礙者的權益及福利，優化不同失能需求的服務，並與醫療接軌，提升民眾的便利性。同時促進婦女發展與權益，進而提升整體社會韌性與永續發展的能力。
此外衛福部表示，增設「國家醫療科技評估中心」行政法人，促進新藥、新醫療科技的決策效率與執行能力，加速民眾取得最新治療，減輕疾病負擔；以及國家中醫藥研究所轉成「國家中醫研究院」行政法人，經由整合資源，發展屬於台灣特色的中醫藥實證醫學與產學模式。
衛福部強調，此次組織調整有助於強化業務整合及提升推動效能。在兒童照護方面，將完善前端預防、中段輔導到後端照顧之組織結構，確保服務連續性；在長者照顧方面，服務將更加多元與順暢；行政法人之設立則將提高用人彈性，吸引醫療科技評估及中醫研究的專業人才。
